Sunt diferite metode de a depista cauzele si pune in evidenta agentului patogen vinovat sau pune in evidenta a infectiei ... de la simpla examinare vizuala si pana la complicate teste de laborator. Unii agenti patogeni sunt detectati la o simpla examinare vizuala (de exemplu paduchii lati), pentru altii este nevoie de o examinare a secretiilor uretrale sau vaginale, examinarii urinei sau examinarii spermei (de exemplu Trichomonas Vaginalis) iar alti agenti patogeni sunt detectati prin teste de sange (teste serologice) (de exemplu Treponema Pallidum).

Diagnosticul poate fi direct sau indirect ... daca in cazul infectiei sifilitice sau gonoreice existenta agentilor patogeni este determinate direct, in cazul infectiei cu virusul imunodeficientei umane (HIV) existenta agentului patogen este pusa in evidenta indirect, testul HIV punand in evidenta anticorpii care apar in urma infectarii si nu virusul in sine.

Dar indiferent daca testele sunt bacteriologice sau serologice, directe sau indirecte, cantitative sau calitative, ele sunt intotdeauna specifice ... asta inseamna ca pentru fiecare agent patogen se face un test anume ... nu se poate detecta cu acelasi test, sa zicem, si infectia gonoreica si infectia si virusul herpetic ... de aceea in cazul in care exista o infectie sexuala datorata unui anume agent patogen, medicul va va face mai multe teste pentu a fi sigur ca nu exista si o infectie "paralela", o infectie ce o insoteste pe cea investigata initial (de exemplu infectia gonoreica este foarte des "insotita" de infectia cu Trichomonas Vaginalis - tricomoniaza).